Гуманитарный лицей был основан 23 октября 1990 г. постановлением Томского облисполкома. Занятия в лицее начались 14 ноября 1990 г., и именно этот день считается Днём рождения лицея. Сначала мы назывались "Томский городской лицей". Через некоторое время, после оформления гуманитарной концепции Лицея, название изменилось.
Гуманитарный лицей – первое в Томске и в Сибири образовательное учреждение, построенное по принципу старшей школы. В лицее реализуются следующие уровни образования: основное общее образование, среднее общее образование. Форма обучения: очная. Нормативные сроки обучения: 8-11 класс – четыре года, 10-11 класс – два года. Образование осуществляется на русском языке. Основные направления: филологическое, социально-историческое, экономическое. Большое внимание уделяется языковой подготовке, в лицее преподаются английский, французский, немецкий, испанский и китайский языки.
«Gens una sumus» («Мы – одна семья») – этот девиз вполне оправдан, поскольку одной из особенностей лицея является его неповторимый дух семьи. Учебный процесс в Лицее отличается ярко выраженным индивидуальным подходом. Преподаватели и лицеисты много общаются и вне учебных занятий, совместно работают над интересными проектами, готовят праздники, спектакли, выпускают газету.
